Uddannelses- og Forskningsministeriet - FNU - Biogenesis and function of circular RNA

Projekter: ProjektForskning

Projektdetaljer

Beskrivelse

It has recently become clear that a large population of cellular RNA forms circles (circRNA) with great impact on function. We have characterized >9.000 examples in porcine brain, many of which are highly abundant and which exhibit complex differential splicing during development. In this project we will analyze the mechanism of biogenesis, intracellular transport and degradation pathway for a particularly highly abundant neuronal circRNA, ciRS-7, that we initially discovered and reported in Nature 2013. We will apply live imaging of RNA dynamics, electron microscopy, proteomics and RNA interference to elucidate the life of a circular RNA in neurons. Through cell and in vivo studies we will investigate the role of ciRS-7 in neuronal homeostasis in rodents by gain and loss of function experiments. The study will be extended to other selected circRNA to investigate the generality of the principles.

Lægmandssprog

RNA kopieres fra DNA som et langt lineært molekyle og efter en modningsproces, hvor dele af RNAet fjernes, bruges det normalt til at kode for proteiner. Det har nu vist sig, bl.a. gennem arbejde fra vores laboratorium, at RNA også kan smelte sammen på en anden måde, så der dannes cirkulære RNAer uden ender. Dette har store implikationer for cellen idet RNAet ikke kan bruges til at kode for proteiner, men derimod nu kan bruges til at regulere andre processer. Det er altså ikke en fejl, men blot en anden måde at bruge RNAet på. Vi har for nyligt opdaget at hjernen i grise (som ligner mennesket i hjernestrukturen) danner flere end 9.000 forskellige cirkler, og at denne, hidtil oversete gruppe af RNAer, kan påvirke cellen på forskellig måde. I denne ansøgning vil vi begynde på at afdække funktionen af udvalgte cirkulære RNAer for bedre at kunne forstå hvilken rolle de spiller i cellen under normale betingelser og i tilfælde af sygdom. Ved at studere deres syntese, bevægelser i cellen og nedbrydning i celler og dyr kan vi få et indblik i deres betydning og mulige anvendelse som mål for sygdomsbehandling.
StatusAfsluttet
Effektiv start/slut dato01/07/201531/08/2019