Projektdetaljer
Beskrivelse
Using our own software, we have found that introns in all human genes harbor pseudoexons (PEs). PEs are nonfunctional exons that disrupt the normal mRNA if they are included during splicing. Therefore PEs represents a vulnerable part of our genome. Typically inclusion of PEs lead to NMD degradation of the mRNA and this is therefore not recognized or simply observed as decreased expression of the affected gene. Intronic SNPs/mutations can affect splicing regulatory elements and activate PE inclusion to cause disease.
| Status | Afsluttet |
|---|---|
| Effektiv start/slut dato | 01/01/2018 → 31/12/2019 |
Fingerprint
Udforsk forskningsemnerne, som dette projekt berører. Disse etiketter er oprettet på grundlag af de underliggende bevillinger/legater. Sammen danner de et unikt fingerprint.
Relaterede publikationer
- 2 Tidsskriftartikel
-
Pseudoexon activation in disease by non-splice site deep intronic sequence variation — wild type pseudoexons constitute high-risk sites in the human genome
Petersen, U. S. S., Doktor, T. K. & Andresen, B. S., feb. 2022, I: Human Mutation. 43, 2, s. 103-127Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil247 Downloads (Pure) -
DeepCLIP: predicting the effect of mutations on protein-RNA binding with deep learning
Grønning, A. G. B., Doktor, T. K., Larsen, S. J., Petersen, U. S. S., Holm, L. L., Bruun, G. H., Hansen, M. B., Hartung, A.-M., Baumbach, J. & Andresen, B. S., 27. jul. 2020, I: Nucleic Acids Research. 48, 13, s. 7099-7118Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil231 Downloads (Pure)