20072019
Hvis du har foretaget ændringer i Pure, vil de snart blive vist her.

Personlig profil

Forskningsområde

Computational Biology. Bioinformatics. Algorithms for Big Data.

Forskningsinformation

My research interests are in computational molecular biology, with a focus on problems involving massive data sets. I am interested in the design of efficient and mathematically well-founded computational techniques to solve problems that arise in the analysis of massive biological data, such as the ones produced by next-generation sequencing technologies. While my primary focus is computational biology, I am also interested in other areas involving big data, such as data mining and large network analysis.

Forskningsområder

  • Bioinformatik
  • Algoritmer for store datamængder

Fingeraftryk Fingeraftryk er baseret på at anvende teksten fra personernes videnskabelige dokumenter til at skabe et indeks med vægtede emneordskoncepter, som definerer de vigtigste emner for hver enkelt forsker.

  • 16 Lignende profiler
Neoplasms Medicin og biovidenskab
Mutation Medicin og biovidenskab
Genes Teknik og materialevidenskab
Dizygotic Twins Medicin og biovidenskab
Libraries Medicin og biovidenskab
Genome-Wide Association Study Medicin og biovidenskab
Sample Size Medicin og biovidenskab
Precision Medicine Medicin og biovidenskab

Netværk Nyligt eksternt samarbejde på landeniveau. Dyk ned i detaljerne ved at klikke på punkterne.

Publikationer 2007 2019

54 Downloads (Pure)

CoExpresso: Assess the quantitative behavior of protein complexes in human cells

Chalabi, M. H., Tsiamis, V., Käll, L., Vandin, F. & Schwämmle, V., 9. jan. 2019, I : BMC Bioinformatics. 20, 1, s. 1-10 17.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil
Cells
Proteins
Protein
Cell
Scoring
18 Downloads (Pure)

Efficient algorithms to discover alterations with complementary functional association in cancer

Basso, R. S., Hochbaum, D. S. & Vandin, F., 1. maj 2019, I : PloS Computational Biology. 15, 5, 24 s., e1006802.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil
cancer
Cancer
Efficient Algorithms
Genes
neoplasms
6 Downloads (Pure)

Enriched power of disease-concordant twin-case-only design in detecting interactions in genome-wide association studies

Li, W., Baumbach, J., Mohammadnejad, A., Brasch-Andersen, C., Vandin, F., Korbel, J. O. & Tan, Q., 1. apr. 2019, I : European Journal of Human Genetics. 27, 4, s. 631-636

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil
Dizygotic Twins
Genome-Wide Association Study
Sample Size
Siblings
Monozygotic Twins
13 Downloads (Pure)

NoMAS: A computational approach to find mutated subnetworks associated with survival in genome-wide cancer studies

Altieri, F., Hansen, T. V. & Vandin, F., apr. 2019, I : Frontiers in Genetics. 10, 12 s., 265.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil
Mutation
Neoplasms
Genetic Heterogeneity
Color
Population
112 Downloads (Pure)

De novo pathway-based biomarker identification

Alcaraz, N., List, M., Batra, R., Vandin, F., Ditzel, H. J. & Baumbach, J., 2017, I : Nucleic Acids Research. 45, 16, 11 s., e151.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil
Neoplasms
Benchmarking
Transcriptome
Datasets

Aktiviteter 2013 2014

  • 9 Peer reviewer/fagfællebedømmer af manuskripter
  • 4 Foredrag og præsentationer i privat eller offentlig virksomhed
  • 3 Organisering af eller deltagelse i konference

Talk: Computational Problems in Cancer Genomics: Towards the ground truth: Exact algorithms for bioinformatics research

Fabio Vandin (Taler)
3. okt. 2014

Aktivitet: Foredrag og mundtlige bidragForedrag og præsentationer i privat eller offentlig virksomhed

PhD school in Computer Science talk (Pisa, Italy): Algorithms to Find Significant Mutations and Pathways in Cancer Genomes

Fabio Vandin (Foredragsholder)
22. sep. 2014

Aktivitet: Foredrag og mundtlige bidragForedrag og præsentationer i privat eller offentlig virksomhed

International Workshop on Big Data and Life Sciences

Fabio Vandin (Arrangør)
20. sep. 2014

Aktivitet: Deltagelse i faglig begivenhedOrganisering af eller deltagelse i konference

ECML-PKDD (Tidsskrift)

Fabio Vandin (Peer reviewer)
15. sep. 201419. sep. 2014

Aktivitet: Redaktionelt arbejde og fagfællebedømmelsePeer reviewer/fagfællebedømmer af manuskripterForskning

International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology

Fabio Vandin (Deltager)
10. jul. 201415. jul. 2014

Aktivitet: Deltagelse i faglig begivenhedOrganisering af eller deltagelse i konference