Publikationer pr. år
Personlig profil
Forskningsområde
Computational Biology. Bioinformatics. Algorithms for Big Data.
Forskningsinformation
My research interests are in computational molecular biology, with a focus on problems involving massive data sets. I am interested in the design of efficient and mathematically well-founded computational techniques to solve problems that arise in the analysis of massive biological data, such as the ones produced by next-generation sequencing technologies. While my primary focus is computational biology, I am also interested in other areas involving big data, such as data mining and large network analysis.
Forskningsområder
- Bioinformatik
- Algoritmer for store datamængder
Fingeraftryk Fingeraftryk er baseret på at anvende teksten fra personernes videnskabelige dokumenter til at skabe et indeks med vægtede emneordskoncepter, som definerer de vigtigste emner for hver enkelt forsker.
- 16 Lignende profiler
Neoplasms
Medicin og biovidenskab
Mutation
Medicin og biovidenskab
Genes
Teknik og materialevidenskab
Dizygotic Twins
Medicin og biovidenskab
Libraries
Medicin og biovidenskab
Genome-Wide Association Study
Medicin og biovidenskab
Sample Size
Medicin og biovidenskab
Precision Medicine
Medicin og biovidenskab
Netværk
Nyligt eksternt samarbejde på landeniveau. Dyk ned i detaljerne ved at klikke på punkterne.
Publikationer 2007 2019
CoExpresso: Assess the quantitative behavior of protein complexes in human cells
Chalabi, M. H., Tsiamis, V., Käll, L., Vandin, F. & Schwämmle, V., 9. jan. 2019, I : BMC Bioinformatics. 20, 1, s. 1-10 17.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang
Fil
Cells
Proteins
Protein
Cell
Scoring
Efficient algorithms to discover alterations with complementary functional association in cancer
Basso, R. S., Hochbaum, D. S. & Vandin, F., 1. maj 2019, I : PloS Computational Biology. 15, 5, 24 s., e1006802.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang
Fil
cancer
Cancer
Efficient Algorithms
Genes
neoplasms
Enriched power of disease-concordant twin-case-only design in detecting interactions in genome-wide association studies
Li, W., Baumbach, J., Mohammadnejad, A., Brasch-Andersen, C., Vandin, F., Korbel, J. O. & Tan, Q., 1. apr. 2019, I : European Journal of Human Genetics. 27, 4, s. 631-636Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang
Fil
Dizygotic Twins
Genome-Wide Association Study
Sample Size
Siblings
Monozygotic Twins
NoMAS: A computational approach to find mutated subnetworks associated with survival in genome-wide cancer studies
Altieri, F., Hansen, T. V. & Vandin, F., apr. 2019, I : Frontiers in Genetics. 10, 12 s., 265.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang
Fil
Mutation
Neoplasms
Genetic Heterogeneity
Color
Population
De novo pathway-based biomarker identification
Alcaraz, N., List, M., Batra, R., Vandin, F., Ditzel, H. J. & Baumbach, J., 2017, I : Nucleic Acids Research. 45, 16, 11 s., e151.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang
Fil
Neoplasms
Benchmarking
Transcriptome
Datasets
Aktiviteter 2013 2014
Talk: Computational Problems in Cancer Genomics: Towards the ground truth: Exact algorithms for bioinformatics research
Fabio Vandin (Taler)3. okt. 2014
Aktivitet: Foredrag og mundtlige bidrag › Foredrag og præsentationer i privat eller offentlig virksomhed
PhD school in Computer Science talk (Pisa, Italy): Algorithms to Find Significant Mutations and Pathways in Cancer Genomes
Fabio Vandin (Foredragsholder)22. sep. 2014
Aktivitet: Foredrag og mundtlige bidrag › Foredrag og præsentationer i privat eller offentlig virksomhed
International Workshop on Big Data and Life Sciences
Fabio Vandin (Arrangør)20. sep. 2014
Aktivitet: Deltagelse i faglig begivenhed › Organisering af eller deltagelse i konference
ECML-PKDD (Tidsskrift)
Fabio Vandin (Peer reviewer)15. sep. 2014 → 19. sep. 2014
Aktivitet: Redaktionelt arbejde og fagfællebedømmelse › Peer reviewer/fagfællebedømmer af manuskripter › Forskning
International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology
Fabio Vandin (Deltager)10. jul. 2014 → 15. jul. 2014
Aktivitet: Deltagelse i faglig begivenhed › Organisering af eller deltagelse i konference