• Campusvej 55

    5230 Odense M

    Danmark

Hvis du har foretaget ændringer i Pure, vil de snart blive vist her.

Publikationer

Filtrer
Tidsskriftartikel
2020

Avoiding H/D Scrambling with Minimal Ion Transmission Loss for HDX-MS/MS-ETD Analysis on a High-Resolution Q-TOF Mass Spectrometer

Wollenberg, D. T. W., Pengelley, S., Mouritsen, J. C., Suckau, D., Jørgensen, C. I. & Jørgensen, T. J. D., 2020, I : Analytical chemistry. 92, 11, s. 7453–7461

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Unfolding of monomeric lipoprotein lipase by ANGPTL4: Insight into the regulation of plasma triglyceride metabolism

Kristensen, K. K., Leth-Espensen, K. Z., Mertens, H. D. T., Birrane, G., Meiyappan, M., Olivecrona, G., Jørgensen, T. J. D., Young, S. G. & Ploug, M., 25. feb. 2020, I : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 117, 8, s. 4337-4346

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
2019

Did evolution create a flexible ligand-binding cavity in the urokinase receptor through deletion of a plesiotypic disulfide bond?

Leth, J. M., Mertens, H. D. T., Leth-Espensen, K. Z., Jørgensen, T. J. D. & Ploug, M., 3. maj 2019, I : Journal of Biological Chemistry. 294, 18, s. 7403-7418

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil
80 Downloads (Pure)

Recommendations for performing, interpreting and reporting hydrogen deuterium exchange mass spectrometry (HDX-MS) experiments

Masson, G. R., Burke, J. E., Ahn, N. G., Anand, G. S., Borchers, C., Brier, S., Bou-Assaf, G. M., Engen, J. R., Englander, S. W., Faber, J., Garlish, R., Griffin, P. R., Gross, M. L., Guttman, M., Hamuro, Y., Heck, A. J. R., Houde, D., Iacob, R. E., Jørgensen, T. J. D., Kaltashov, I. A. & 20 flere, Klinman, J. P., Konermann, L., Man, P., Mayne, L., Pascal, B. D., Reichmann, D., Skehel, M., Snijder, J., Strutzenberg, T. S., Underbakke, E. S., Wagner, C., Wales, T. E., Walters, B. T., Weis, D. D., Wilson, D. J., Wintrode, P. L., Zhang, Z., Zheng, J., Schriemer, D. C. & Rand, K. D., 27. jun. 2019, I : Nature Methods. 16, 7, s. 595-602

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil
194 Downloads (Pure)
2018

A disordered acidic domain in GPIHBP1 harboring a sulfated tyrosine regulates lipoprotein lipase

Kristensen, K. K., Midtgaard, S. R., Mysling, S., Kovrov, O., Hansen, L. B., Skar-Gislinge, N., Beigneux, A. P., Kragelund, B. B., Olivecrona, G., Young, S. G., Jørgensen, T. J. D., Fong, L. G. & Ploug, M., 26. jun. 2018, I : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 115, 26, s. E6020-E6029

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil
147 Downloads (Pure)

Long-Lived Folding Intermediates Predominate the Targeting-Competent Secretome

Tsirigotaki, A., Chatzi, K. E., Koukaki, M., De Geyter, J., Portaliou, A. G., Orfanoudaki, G., Sardis, M. F., Trelle, M. B., Jørgensen, T. J. D., Karamanou, S. & Economou, A., 1. maj 2018, I : Structure. 26, 5, s. 695-707.e5

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
2017

An Asymmetric Runaway Domain Swap Antithrombin Dimer as a Key Intermediate for Polymerization Revealed by Hydrogen/Deuterium-Exchange Mass Spectrometry

Trelle, M. B., Pedersen, S., Østerlund, E. C., Madsen, J. B., Kristensen, S. R. & Jørgensen, T. J. D., 2017, I : Analytical Chemistry. 89, 1, s. 616–624

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil
273 Downloads (Pure)

Dissecting the interaction between transglutaminase 2 and fibronectin

Cardoso, I., Østerlund, E. C., Stamnaes, J., Iversen, R., Andersen, J. T., Jørgensen, T. J. D. & Sollid, L. M., 2017, I : Amino Acids. 49, 3, s. 489-500

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil
178 Downloads (Pure)

The T-Cell Receptor Can Bind to the Peptide-Bound Major Histocompatibility Complex and Uncomplexed β2-Microglobulin through Distinct Binding Sites

Merkle, P. S., Irving, M., Hongjian, S., Ferber, M., Jørgensen, T. J. D., Scholten, K., Luescher, I., Coukos, G., Zoete, V., Cuendet, M. A., Michielin, O. & Rand, K. D., 2017, I : Biochemistry. 56, 30, s. 3945-3961

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Uranyl Photocleavage of Phosphopeptides Yields Truncated C-Terminally Amidated Peptide Products

Elnegaard, R. L. B., Møllegaard, N. E., Zhang, Q., Kjeldsen, F. & Jørgensen, T. J. D., 2017, I : ChemBioChem. 18, 12, s. 1117-1122

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil
162 Downloads (Pure)
2016

An RNA Aptamer Inhibits a Mutation-Induced Inactivating Misfolding of a Serpin

Madsen, J. B., Andersen, L. M., Dupont, D. M., Trelle, M. B., Johansen, J. S., Jensen, J. K., Jørgensen, T. J. D. & Andreasen, P. A., 2016, I : Cell Chemical Biology. 23, 6, s. 700-708

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Copper(II) ions increase plasminogen activator inhibitor type 1 dynamics in key structural regions that govern stability

Bucci, J. C., Trelle, M. B., McClintock, C. S., Qureshi, T., Jørgensen, T. J. D. & Peterson, C. B., 9. aug. 2016, I : Biochemistry. 55, 31, s. 4386-4398

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Epitope-dependent functional effects of celiac disease autoantibodies on transglutaminase 2

Hnida, K., Stamnaes, J., du Pré, M. F., Mysling, S., Jørgensen, T. J. D., Sollid, L. M. & Iversen, R., 2. dec. 2016, I : Journal of Biological Chemistry. 291, 49, s. 25542-25552

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil
195 Downloads (Pure)

Removal of N-linked glycosylations at acidic pH by PNGase a facilitates hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry analysis of N-Linked glycoproteins

Jensen, P. F., Comamala, G., Trelle, M. B., Madsen, J. B., Jørgensen, T. J. D. & Rand, K. D., 2016, I : Analytical Chemistry. 88, 24, s. 12479-12488

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

The acidic domain of the endothelial membrane protein GPIHBP1 stabilizes lipoprotein lipase activity by preventing unfolding of its catalytic domain

Mysling, S., Kristensen, K. K., Larsson, M., Beigneux, A. P., Gårdsvoll, H., Fong, L. G., Bensadouen, A., Jørgensen, T. J. D., Young, S. G. & Ploug, M., 3. jan. 2016, I : eLife. 5, 24 s., e12095.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil
211 Downloads (Pure)

The angiopoietin-like protein ANGPTL4 catalyzes unfolding of the hydrolase domain in lipoprotein lipase and the endothelial membrane protein GPIHBP1 counteracts this unfolding

Mysling, S., Kristensen, K. K., Larsson, M., Kovrov, O., Bensadouen, A., Jørgensen, T. J. D., Olivecrona, G., Young, S. G. & Ploug, M., 8. dec. 2016, I : eLife. 5, 18 s., e20958.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil
223 Downloads (Pure)
2015

Conformational Analysis of Large and Highly Disulfide-Stabilized Proteins by Integrating Online Electrochemical Reduction into an Optimized H/D Exchange Mass Spectrometry Workflow

Trabjerg, E., Jakobsen, R. U., Mysling, S., Christensen, S., Jørgensen, T. J. D. & Rand, K. D., 1. sep. 2015, I : Analytical Chemistry. 87, 17, s. 8880-8888

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Effect of Metals in Biomimetic Dimetal Complexes on Affinity and Gas-Phase Protection of Phosphate Esters

Svane, S., Jørgensen, T. J. D., McKenzie, C. & Kjeldsen, F., 2015, I : Analytical Chemistry. 87, 14, s. 7060–7068

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil
200 Downloads (Pure)
2014

Activity-regulating structural changes and autoantibody epitopes in transglutaminase 2 assessed by hydrogen/deuterium exchange

Iversen, R., Mysling, S., Hnida, K., Jørgensen, T. J. D. & Sollid, L. M., 2. dec. 2014, I : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 48, s. 17146-51

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

A phosphorylation tag for uranyl mediated protein purification and photo assisted tag removal

Zhang, Q., Jørgensen, T. J. D., Nielsen, P. E. & Møllegaard, N. E., 2014, I : PLOS ONE. 9, 3, s. e91138

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Co-existence of two different α-synuclein oligomers with different core structures determined by hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry

Paslawski, W., Mysling, S., Thomsen, K., Jørgensen, T. J. D. & Otzen, D. E., 14. jul. 2014, I : Angewandte Chemie International Edition. 53, 29, s. 7560-7563 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Dissecting the Effect of RNA Aptamer Binding on the Dynamics of Plasminogen Activator Inhibitor 1 Using Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry

Trelle, M. B., Dupont, D. M., Madsen, J. B., Andreasen, P. & Jørgensen, T. J. D., 2014, I : A C S Chemical Biology. 9, 1, s. 174-182

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Electrochemical reduction of disulfide-containing proteins for hydrogen/deuterium exchange monitored by mass spectrometry

Mysling, S., Salbo, R., Ploug, M. & Jørgensen, T. J. D., 2014, I : Analytical Chemistry. 86, 1, s. 340-345

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Ion source parameters and hydrogen scrambling in the ECD of selectively deuterated peptides

Duchateau, M., Jørgensen, T. J. D., Robine, O., Nicol, E., Malosse, C., Chamot-Rooke, J. & Van Der Rest, G., 15. jun. 2014, I : International Journal of Mass Spectrometry. 367, s. 21-27

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Local transient unfolding of native state PAI-1 associated with serpin metastability

Trelle, M. B., Madsen, J. B., Andreasen, P. A. & Jørgensen, T. J. D., 8. sep. 2014, I : Angewandte Chemie International Edition. 53, 37, s. 9751-9754 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Measuring the hydrogen/deuterium exchange of proteins at high spatial resolution by mass spectrometry: overcoming gas-phase hydrogen/deuterium scrambling

Rand, K. D., Zehl, M. & Jørgensen, T. J. D., 21. okt. 2014, I : Accounts of Chemical Research. 47, 10, s. 3018-27 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Molecular mechanism of regulation of the atypical protein kinase C by N-terminal domains and an allosteric small compound

Zhang, H., Neimanis, S., Lopez-Garcia, L. A., Arencibia, J. M., Amon, S., Stroba, A., Zeuzem, S., Proschak, E., Stark, H., Bauer, A. F., Busschots, K., Jørgensen, T. J. D., Engel, M., Schulze, J. O. & Biondi, R. M., 19. jun. 2014, I : Chemistry & Biology. 21, 6, s. 754-65 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

On the photostability of peptides after selective photoexcitation of the backbone: prompt versus slow dissociation

Byskov, C. S., Jensen, F., Jørgensen, T. J. D. & Nielsen, S. B., 14. aug. 2014, I : Physical chemistry chemical physics : PCCP. 16, 30, s. 15831-8

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

2013

Affinity capture of biotinylated proteins at acidic conditions to facilitate hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry analysis of multimeric protein complexes

Jensen, P. F., Jørgensen, T. J. D., Koefoed, K., Nygaard, F. & Sen, J. W., 2013, I : Analytical Chemistry. 85, 15, s. 7052-7059

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Characterizing the Dynamics of α-Synuclein Oligomers Using Hydrogen/Deuterium Exchange Monitored by Mass Spectrometry

Mysling, S., Betzer, C., Jensen, P. H. & Jørgensen, T. J. D., 2013, I : Biochemistry. 52, 51, s. 9097–9103

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Heteromeric Complexes of Native Collectin Kidney 1 and Collectin Liver 1 Are Found in the Circulation with MASPs and Activate the Complement System

Henriksen, M. L., Brandt, J., Andrieu, J-P., Nielsen, C., Jensen, P. H., Holmskov, U., Jørgensen, T. J. D., Palarasah, Y., Thielens, N. M. & Hansen, S., 15. dec. 2013, I : Journal of Immunology. 191, 12, s. 6117-27 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Improved PET imaging of uPAR expression using new (64)Cu-labeled cross-bridged peptide ligands: comparative in vitro and in vivo studies

Persson, M., Hosseini, M., Madsen, J., Jørgensen, T. J. D., Jensen, K. J., Kjaer, A. & Ploug, M., 2013, I : Theranostics. 3, 9, s. 618-32 15 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

2012

A Flexible Multidomain Structure Drives the Function of the Urokinase-type Plasminogen Activator Receptor (uPAR)

Mertens, H., Kjaergaard, M., Mysling, S., Gardvoll, H., Jørgensen, T. J. D., Svergun, D. & Ploug, M., 2012, I : Journal of Biological Chemistry. 287, 41, s. 34304-34315

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

An enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) for quantification of human collectin 11 (CL-11, CL-K1)

Selman, L., Henriksen, M. L., Brandt, J., Palarasah, Y., Waters, A., Beales, P. L., Holmskov, U., Jørgensen, T. J. D., Nielsen, C., Skjodt, K. & Hansen, S., 2012, I : Journal of Immunological Methods. 375, 1-2, s. 182-8 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry Reveals Specific Changes in the Local Flexibility of Plasminogen Activator Inhibitor 1 upon Binding to the Somatomedin B Domain of Vitronectin

Trelle, M. B., Hirschberg, D., Jansson, A., Ploug, M., Roepstorff, P., Andreasen, P. & Jørgensen, T. J. D., 2012, I : Biochemistry. 51, 41, s. 8256-8266

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Spatially resolved protein hydrogen exchange measured by subzero-cooled chip-based nanoelectrospray ionization tandem mass spectrometry

Amon, S., Trelle, M. B., Jensen, O. N. & Jørgensen, T. J. D., 2012, I : Analytical Chemistry. 84, 10, s. 4467-73 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

The interaction of the antitoxin DM43 with a snake venom metalloproteinase analyzed by mass spectrometry and surface plasmon resonance

Brand, G. D., Salbo, R., Jørgensen, T. J. D., Bloch, C., Boeri Erba, E., Robinson, S. C., Tanjoni, I., Moura-da-Silva, A. M., Roepstorff, P., Domont, G. B., Perales, J., Valente, R. H. & Neves-Ferreira, A. G. C., 2012, I : Journal of Mass Spectrometry. 47, 5, s. 567-73 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Traveling-wave ion mobility mass spectrometry of protein complexes: accurate calibrated collision cross-sections of human insulin oligomers

Salbo, R., Bush, M. F., Naver, H., Campuzano, I., Robinson, C. V., Pettersson, I. V., Jørgensen, T. J. D. & Haselmann, K. F., 2012, I : Rapid Communications in Mass Spectrometry. 26, 10, s. 1181-93 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

2011

Allosteric regulation of protein kinase PKCζ by the N-terminal C1 domain and small compounds to the PIF-pocket

Lopez-Garcia, L. A., Schulze, J. O., Fröhner, W., Zhang, H., Süss, E., Weber, N., Navratil, J., Amon, S., Hindie, V., Zeuzem, S., Jørgensen, T. J. D., Alzari, P. M., Neimanis, S., Engel, M. & Biondi, R. M., 2011, I : Chemistry & Biology. 18, 11, s. 1463-73 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Investigation of Amide Hydrogen Back-Exchange in Asp and His Repeats Measured by Hydrogen (1H/2H) Exchange Mass Spectrometry

Rand, K. D., Lund, F. W., Amon, S. & Jørgensen, T. J. D., 2011, I : International Journal of Mass Spectrometry. 302, 1-3, s. 110-115

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

On the intrinsic optical absorptions by tetrathiafulvalene radical cations and isomers

Kirketerp, M-B. S., Leal, L. A. E., Varsano, D., Rubio, A., Jørgensen, T. J. D., Kilså, K., Nielsen, M. B. & Nielsen, S. B., 28. jun. 2011, I : Chemical Communications. 47, 24, s. 6900-2 3 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Spatially resolved protein hydrogen exchange measured by matrix-assisted laser desorption ionization in-source decay

Rand, K. D., Bache, N., Nedertoft, M. M. & Jørgensen, T. J. D., 2011, I : Analytical Chemistry. 83, 23, s. 8859-62 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

2010

Collectin 11 (CL-11, CL-K1) Is a MASP-1/3-Associated Plasma Collectin with Microbial-Binding Activity

Hansen, S., Sellman, L., Palaniyar, N., Ziegler, K., Brandt, J., Kliem, A., Jonasson, M., Skjoedt, M-O., Nielsen, O., Hartshorn, K., Jørgensen, T. J. D., Skjødt, K. & Holmskov, U., 15. nov. 2010, I : Journal of Immunology. 185, 10, s. 6096-104 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Loss of ammonia during electron-transfer dissociation of deuterated peptides as an inherent gauge of gas-phase hydrogen scrambling

Rand, K. D., Zehl, M., Jensen, O. N. & Jørgensen, T. J. D., 1. dec. 2010, I : Analytical Chemistry. 82, 23, s. 9755-62 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

2009

Protein hydrogen exchange measured at single-residue resolution by electron transfer dissociation mass spectrometry

Rand, K. D., Zehl, M., Jensen, O. N. & Jørgensen, T. J. D., 15. jul. 2009, I : Analytical Chemistry. 81, 14, s. 5577-5584 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Structure and allosteric effects of low-molecular-weight activators on the protein kinase PDK1

Hindie, V., Stroba, A., Zhang, H., Lopez-Garcia, L. A., Idrissova, L., Zeuzem, S., Hirschberg, D., Schaeffer, F., Jørgensen, T. J. D., Engel, M., Alzari, P. M. & Biondi, R. M., 1. okt. 2009, I : Nature Chemical Biology. 5, 10, s. 758-764 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

2008

Electron capture dissociation proceeds with a low degree of intramolecular migration of peptide amide hydrogens

Rand, K. D., Adams, C. M., Zubarev, R. A. & Jørgensen, T. J. D., 30. jan. 2008, I : Journal of the American Chemical Society. 130, 4, s. 1341-1349 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Electron transfer dissociation facilitates the measurement of deuterium incorporation into selectively labeled peptides with single residue resolution

Zehl, M., Rand, K. D., Jensen, O. N. & Jørgensen, T. J. D., 24. dec. 2008, I : Journal of the American Chemical Society. 130, 51, s. 17453-17459 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Gas-phase fragmentation of peptides by MALDI in-source decay with limited amide hydrogen (1H/2H) scrambling

Bache, N., Rand, K. D., Roepstorff, P. & Jørgensen, T. J. D., 15. aug. 2008, I : Analytical Chemistry. 80, 16, s. 6431-6435 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review