Poul Nielsen

ph.d.

  • Campusvej 55

    5230 Odense M

    Danmark

1994 …2021
Hvis du har foretaget ændringer i Pure, vil de snart blive vist her.

Publikationer 1994 2019

  • 106 Tidsskriftartikel
  • 5 Konferenceabstrakt til konference
  • 1 Bidrag til bog/antologi
  • 1 Konferenceabstrakt i tidsskrift
Filtrer
Tidsskriftartikel
2019

A double-headed nucleotide with two cytosines: DNA with condensed information and improved duplex stability

Beck, K., Reslow-Jacobsen, C., Hornum, M., Henriksen, C. & Nielsen, P., 1. mar. 2019, I : Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters. 29, 5, s. 740-743

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Cytosine
Nucleotides
Oligonucleotides
Monomers
DNA

Base-Pairing Properties of Double-Headed Nucleotides

Hornum, M., Stendevad, J., Sharma, P. K., Kumar, P., Nielsen, R. B., Petersen, M. & Nielsen, P., 28. maj 2019, I : Chemistry: A European Journal. 25, 30, s. 7387-7395

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Base Pairing
Hypoxanthine
DNA
Guanine
Adenine
2017
90 Downloads (Pure)

Nucleobase-modified antisense oligonucleotides containing 5-(phenyltriazol)-2′-deoxyuridine nucleotides induce exon-skipping: In vitro

Le, B. T., Hornum, M., Sharma, P. K., Nielsen, P. & Veedu, R. N., 2017, I : RSC Advances. 7, 86, s. 54542-54545

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil
Deoxyuridine
Antisense Oligonucleotides
Oligonucleotides
Nucleotides
Exons

Synthesis, hybridization and fluorescence properties of a 2'-C-pyrene-triazole modified arabino-uridine nucleotide

Kumar, P., Sharma, P. K. & Nielsen, P., 2017, I : Bioorganic & Medicinal Chemistry. 25, 7, s. 2084–2090

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Uracil Nucleotides
Triazoles
Monomers
Fluorescence
Oligonucleotides
2016

Double-Headed Nucleotides: Building Blocks for New Nucleic Acid Architectures

Sharma, P. K., Kumar, P. & Nielsen, P., 2016, I : Australian Journal of Chemistry. 69, 10, s. 1094-1101

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

98 Downloads (Pure)

Synthesis of new C-5-triazolyl-functionalized thymidine analogs and their ability to engage in aromatic stacking in DNA:DNA and DNA:RNA duplexes

Hornum, M., Djukina, A., Sassnau, A-K. & Nielsen, P., 2016, I : Organic & Biomolecular Chemistry. 19, s. 4436-4447

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil

Three new double headed nucleotides with additional nucleobases connected to C-5 of pyrimidines: synthesis, duplex and triplex studies

Kumar, P., Sharma, P. K., Hansen, J., Jedinak, L., Reslow-Jacobsen, C., Hornum, M. & Nielsen, P., 2016, I : Bioorganic & Medicinal Chemistry. 24, 4, s. 742-749

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

2015

Allele Selective Inhibition of Mutant Huntingtin With 2-Thio- and C5-Triazoylphenyl- Deoxythymidine Modified Antisense Oligonucleotides

Østergaard, M. E., Kumar, P., Nichols, J., Watt, A., Sharma, P. K., Nielsen, P. & Seth, P. P., 2015, I : Nucleic Acid Therapeutics. 25, 5, s. 266-274

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

81 Downloads (Pure)

Double-headed nucleotides introducing thymine nucleobases in the major groove of nucleic acid duplexes

Jensen, M. D., Andersen, N. K., Kumar, P., Nielsen, P. & Sharma, P. K., 2015, I : Organic & Biomolecular Chemistry. 13, s. 7040-7049

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil

Increasing the stability of DNA: RNA duplexes by introducing stacking phenyl-substituted pyrazole, furan and triazole moieties in the major groove

Hornum, M., Kumar, P., Podsiadly, P. & Nielsen, P., 2015, I : Journal of Organic Chemistry. 80, 19, s. 9592-9602

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

2014
Click Chemistry
Adenine
Derivatives
Escherichia coli
Growth

Double-coding nucleic acids; Introduction of a nucleobase sequence in the major groove of the DNA duplex using double-headed nucleotides

Kumar, P., Sorinas, A. F., Nielsen, L. J., Slot, M., Skytte, K., Nielsen, A. S., Jensen, M. D., Sharma, P. K., Vester, B., Petersen, M. & Nielsen, P., 2014, I : Journal of Organic Chemistry. 79, s. 8020-8030 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Double-headed nucleotides with arabino-configuration; synthesis and hybridization properties

Kumar, P., Sharma, P. K. & Nielsen, P., 2014, I : Journal of Organic Chemistry. 79, s. 11534-11540 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

High affinity RNA targeting by oligonucleotides displaying aromatic stacking and amino groups in the major groove. Comparison of triazoles and phenylsubstituents

Kumar, P., Hornum, M., Nielsen, L. J., Enderlin, G., Andersen, N. K., Len, C., Hervé, G., Sartori, G. & Nielsen, P., 2014, I : Journal of Organic Chemistry. 79, 7, s. 2854-2863 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Synthesis of a bicyclic double-headed nucleoside

Kumar, S., Steffansen, S. I., Albæk, N. & Nielsen, P., 2014, I : Tetrahedron. 70, 3, s. 583-589

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

2013

Double-headed nucleotides in DNA-zipper structures; base-base interactions and UV-induced cross-coupling in the minor groove

Stahl Madsen, C., Nielsen, L. J., Pedersen, N. S., Lauritsen, A. & Nielsen, P., 2013, I : R S C Advances. 3, s. 10696-10706

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Synthesis of 2´-O-(thymin-1-yl)methyluridine and its incorporation into secondary nucleic acid structures.

Kumar, P., Stahl Madsen, C. & Nielsen, P., 2013, I : Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters. 23, s. 6847-6850

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

The extension of a DNA double helix by an additional Watson-Crick base pair on the same backbone

Kumar, P., Sharma, P. K., Madsen, C. S., Petersen, M. & Nielsen, P., 2013, I : ChemBioChem. 14, 9, s. 1072-1074

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Base Pairing
Nucleotides
DNA
2012

A Click Chemistry Approach to Pleuromutilin Derivatives, Part 2: Conjugates with Acyclic Nucleosides and Their Ribosomal Binding and Antibacterial Activity

Dreier, I., Kumar, S., Søndergaard, H., Rasmussen, M. L., Hansen, L. H., List, N. H., Kongsted, J., Vester, B. & Nielsen, P., 2012, I : Journal of Medicinal Chemistry. 55, 5, s. 2067-2077

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Additional Base Pair Formation in DNA Duplexes by a Double-Headed Nucleotide

Stahl Madsen, C., Witzke, S., Kumar, P., Negi, K., Sharma, P. K., Petersen, M. & Nielsen, P., 2012, I : Chemistry: A European Journal. 18, s. 7434-7442 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Sulfonamide bearing oligonucleotides: Simple synthesis and efficient RNA recognition

Kumar, P., Chandak, N., Nielsen, P. & Sharma, P. K., 2012, I : Bioorganic & Medicinal Chemistry. 20, 12, s. 3843-3849 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Three pyrene modified nucleotides; synthesis and effects in secondary nucleic acid structures

Kumar, P., Shaikh, K. I., Jørgensen, A. S., Kumar, S. & Nielsen, P., 2012, I : Journal of Organic Chemistry. 77, s. 9562−9573 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

2011

Duplex and Triplex Formation of Mixed Pyrimidine Oligonucleotides with Stacking of Phenyl-triazole Moieties in the Major Groove

Andersen, N. K., Døssing, H., Jensen, F., Vester, B. & Nielsen, P., 5. aug. 2011, I : Journal of Organic Chemistry. 76, 15, s. 6177-87 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Triazoles
Uridine
Oligonucleotides
Cytidine
Complementary RNA

High-affinity DNA-targeting using Readily Accessible Mimics of N2’-Functionalized 2’-Amino-α-L-LNA

Karmakar, S., Anderson, B. A., Rathje, R. L., Andersen, S., Jensen, T. B., Nielsen, P. & Hrdlicka, P. J., 2011, I : Journal of Organic Chemistry. 76, s. 7119-7131 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Introduction of Additional Nucleobases into the Double Helix

Nielsen, P., Stahl Madsen, C., Jørgensen, A. S., Witzke, S., Shaikh, K. I., Kumar, P., Sharma, P. K. & Petersen, M., 2011, I : Collection Symposium Series. 12, s. 189-193 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

The synthesis of double-headed nucleosides by the CuAAC reaction and their effect in secondary nucleic acid structures

Jørgensen, A. S., Shaikh, K. I., Enderlin, G., Ivarsen, E., Kumar, S. & Nielsen, P., 2011, I : Organic & Biomolecular Chemistry. 9, s. 1381 - 1388 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

2010

Efficient RNA-targeting by the introduction of aromatic stacking in the duplex major groove via 5-(1-phenyl-1,2,3-triazol-4-yl)-2′-deoxyuridines.

Andersen, N. K., Chandak, N., Brulikova, L., Kumar, P., Jensen, M. D., Jensen, F., Sharma, P. K. & Nielsen, P., 2010, I : Bioorganic & Medicinal Chemistry. 18, s. 4702-4710 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Synthesis and molecular modelling of double-functionalized nucleosides with aromatic moieties in the 5´(S)-position and minor groove interactions in DNA zipper structures

Shaikh, K. I., Madsen, C. S., Nielsen, L. J., Jørgensen, A. S., Nielsen, H., Petersen, M. & Nielsen, P., 2010, I : Chemistry: A European Journal. 16, s. 12904-12919 16 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

2009

Parallel RNA-strand recognition by 2'-amino-β-LNA

Kumar, T. S., Østergaard, M. E., Sharma, P. K., Nielsen, P., Wengel, J. & Hrdlicka, P. J., 2009, I : Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters. 19, 9, s. 2396-2399 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Thymine
RNA
Complementary RNA
Nucleosides
Monomers

Synthesis of bicyclic 2´-deoxynucleosides with α-L-ribo- and β-D-xylo-configurations and restricted S- and N-type conformations

Shaikh, K. I., Kumar, S., Lundhus, L., Bond, A., Sharma, P. K. & Nielsen, P., 2009, I : Journal of Organic Chemistry. 74, 4, s. 1557-1566 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Synthesis of Functionalized Carbocyclic Locked Nucleic Acid Analogues by Ring-Closing Diene and Enyne Metathesis and their Influence on Nucleic Acid Stability and Structure

Kumar, S., Haslund Hansen, M., Albæk, N., Inglev Steffansen, S., Petersen, M. & Nielsen, P., 2009, I : Journal of Organic Chemistry. 74, 17, s. 6756-6769 14 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

2008

A click chemistry approach to Pleuromutilin conjugates with nucleosides or acyclic nucleoside derivatives and their binding to the bacterial ribosome

Lolk, L., Pøhlsgaard, J., Jepsen, A. S., Hansen, L. H., Nielsen, H., Steffansen, S. I., Sparving, L., NIelsen, A. B., Vester, B. & Nielsen, P., 5. aug. 2008, I : Journal of Medicinal Chemistry. 51, s. 4957-4967 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

A click chemistry approach towards nucleic acid major groove functionalization

Andersen, N. K., Spacilova, L., Jensen, M. D., Kocalka, P., Jensen, F. & Nielsen, P., 8. sep. 2008, I : Nucleic Acids Symposium Series. 52, s. 149-150 2 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

Chemically modified oligonucleotides with efficient RNase H response

Vester, B., Boel, A. M., Lobedanz, S., Babu, B. R., Raunkjaer, M., Lindegaard, D., Raunak, Hrdlicka, P. J., Højland, T., Sharma, P. K., Kumar, S., Nielsen, P. & Wengel, J., 1. apr. 2008, I : Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters. 18, 7, s. 2296-2300 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Ribonuclease H
Oligonucleotides
RNA
Complementary RNA
DNA

Nucleic acid duplexes with zippers of additional nucleobases and aromatics in minor or major groove

Nielsen, P., Shaikh, K. I., Nielsen, L. J., Andersen, N. K., Spacilova, L., Nielsen, H., Kocalka, P. & Christensen, M. S., 2008, I : Nucleic Acids Symposium Series. 52, s. 5-6 2 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

Nucleic acid secondary structures containing the double-headed nucleoside 5′(S)-C-(2-(thymine-1-yl)ethyl)­thymidine.

Andersen, C., Sharma, P. K., Christensen, M. S., Steffansen, S. I., Madsen, C. M. & Nielsen, P., 2008, I : Organic & Biomolecular Chemistry. 6, s. 3983-3988 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Palladium-Catalyzed Three-Component Approach to Promazine with Formation of One Carbon-Sulfur and Two Carbon-Nitrogen Bonds

Dahl, T., Tornøe, C. W., Bang-Andersen, B., Nielsen, P. & Jørgensen, M., 2008, I : Angewandte Chemie - International Edition. 47, 9, s. 1726-1728 3 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Synthesis of 3´- and 6´-functionalised Locked Nucleic Acid (LNA) analogues

Sharma, P. K., Enderlin, G., Kumar, S. & Nielsen, P., 8. sep. 2008, I : Nucleic Acids Symposium Series. 52, s. 135-136 2 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

Synthesis of 6´-branched Locked Nucleic Acid by a radical TEMPO-scavanged stereoselective mercurycyclization

Enderlin, G. & Nielsen, P., 2. aug. 2008, I : Journal of Organic Chemistry. 73, s. 6891-6894 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Synthesis of double-headed nucleosides with the additional nucleobase in the 5´-C-position

Andersen, C., Sharma, P. K., Pedersen, N. S., Christensen, M. S. & Nielsen, P., 2008, I : Nucleic Acids Symposium Series. 52, s. 275-276 2 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

Synthesis of the 3′-C-hydroxymethyl-branched locked nucleic acid thymidine monomer

Kumar, S., Sharma, P. K., Stein, P. C. & Nielsen, P., 2008, I : European Journal of Organic Chemistry. 2008, 34, s. 5715-5722 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Ether
Thymidine
Monomers
Glucose
3-hydroxybutanal

Synthetic nucleic acid secondary structures containing the four stereoisomers of 1,4-bis(thymine-1-yl)butane-2,3-diol

Christensen, M. S., Bond, A. & Nielsen, P., 2008, I : Organic & Biomolecular Chemistry. 6, s. 81-91 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

2007

(1R,4R,7R,8R,9R)-8-Benzyloxy-7-benzyloxymethyl-2,5,10-trioxatricyclo[5.2.1.04,8]decan-9-ol

Sharma, P. K., Nielsen, P. & Bond, A., 2007, I : Acta Crystallographica. Section E: Structure Reports Online. E63, s. o4537

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Collision-induced dissociation of cytidine and its derivatives

Jensen, S. S., Ariza, X., Nielsen, P., Vilarrasa, J. & Kirpekar, F., 1. jan. 2007, I : Journal of Mass Spectrometry. 42, 1, s. 49-57 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

LNA (locked nucleic acid) and analogs as triplex-forming oligonucleotides

Højland, T., Kumar, S., Babu, B. R., Umemoto, T., Albaek, N., Sharma, P. K., Nielsen, P. & Wengel, J., 2007, I : Organic & Biomolecular Chemistry. 5, 15, s. 2375-9 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Oligonucleotides
Monomers
Conformations
Nucleotides
locked nucleic acid

Selective reduction of mono- and disubstituted olefins by NaBH4 and catalytic RuCl3

Sharma, P. K., Kumar, S., Kumar, P. & Nielsen, P., 2007, I : Tetrahedron Letters. 48, s. 8704-8708 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Synthesis and modelling of DNA junction and minor groove zipper motifs incorporating the double-headed nucleoside 5'(S)-C-(thymine-1-ylmethyl)-thymidine

Christensen, M. S., Madsen, C. M. & Nielsen, P., 2007, I : Organic & Biomolecular Chemistry. 5, s. 1586-1594 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Synthesis of  5-(1,2,3-triazol-4-yl)-2'-deoxy­uridines by a click chemistry approach;  stacking of triazoles in the major groove gives increased nucleic acid duplex stability

Kocalka, P., Andersen, N. K., Jensen, F. & Nielsen, P., 2007, I : ChemBioChem. 8, s. 2106-2116 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Synthesis of a Branched Locked Nucleic Acid (LNA) Analogue

Sharma, P. K., Kumar, S. & Nielsen, P., 2007, I : Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids. 26, s. 1505-1508 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Synthesis of Nucleosides with Additional Nucleobases

Andersen, C., Pedersen, S. L. & Nielsen, P., 2007, I : Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids. 26, s. 1435-1438 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review